Arcella vulgaris
【和名：ナベカムリ】 殻は100～150μm．中央の孔から偽足を出す．全国の池沼，腐植性水域に分布する代表的な有殻アメーバ．
Arthrospira maxima
【和名：】 規則正しくコイルに巻き，細胞は灰緑色を呈する．浮遊性種．国内で多産した例はほとんどないが，熱帯域では優占種となり「水の華」を形成することが知られる．
Asplanchna herricki
【和名：ヘリックフクロムシ】 500～1500μm．透明な袋状で，体の側方に突出部がある．全国の湖沼に普通み見られる．
Aulacoseira granulata
【和名： 】 長さ5〜25μmの円筒形．端に細長い刺を持つことで，他と区別できる．点紋は，刺を持つ細胞では長軸に平行するが，他は斜行する．中〜富栄養湖に広く見られる．
Aulacoseira japonica
【和名： 】 長さ10μm前後．Aulacoseira ambiguaの螺旋状の群体と考えられる．ただ，この螺旋状のものは，より富栄養化が進んだ湖沼に多く，優占種となる例もあり，一応種として扱った．
Aulacoseira nipponica
【和名： 】 長さ10～13μmの円筒形．歯状刺は3～4μm．琵琶湖の固有種で，かつてはMelosira solidaとされていた．1980年代までは冬季の代表種であったが，最近では少ない．
Bacillaria paxillifera
【和名： 】 長さ60～150μm．筏状の群体を形成する．汽水域の代表種であるが，淡水域にも出現する．従来，Bacillaria paradoxaとして扱われてきた．全国的に見られる．
Bosmina longirostris
【和名：ゾウミジンコ】 0.4～0.8mmの卵円形のミジンコ．第1触角が前下方へ伸び，ゾウの鼻のように見える．雄ではこの部分がくびれ，雌と体型が異なる．全国の湖や池沼に広く分布する中栄養型プランクトンの代表種．
