Pseudanabaena mucicola
【和名：】 長さ1.3～2.0μmの円筒形で，数個が真直ぐな短い糸状の群体を形成する．Microcystis属の群体中に散在して生活することで知られている．
Scapholeberis kingi
【和名：タイリクアオムキミジンコ】 体長0.7～1.1mm．水面に腹面を接して（あお向きに）浮遊することで知られる．全国の溜池，水田，養魚池などに広く見られる．外来種．
Scenedesmus denticulatus
【和名： 】 細胞は長さが5～15μmの楕円形．棘は短い．4～8細胞で群体（シノビウム）を形成する．全国の池沼に分布する．
Scenedesmus opoliensis
【和名： 】 細胞は長さが10～25μmの紡錘形．棘が強大．4～8細胞で群体（シノビウム）を形成する．全国の池沼に分布する．
Schizocerca diversicornis
【和名：ツノワムシ】 体長19～380μmで，前端に大小4本，後端に2本の刺状突起を持つ．棘の長さは変異が大きい．全国の湖沼に分布する．
Sellaphora moesta Syn. Navicula americana var. moesta
【和名： 】 大塚泰介氏がN. americanaの変種var. moestaとされていたものを種に格上げしてSellaphora属の一種とした．両側が平行せず，中央部がやや細くなることでSellaphora ameri …
Sida ortiva
【和名： 】 体調0.8～2.5mm．湖沼の水草帯に生息するミジンコで，頭部背面の固着器官で水草に付着する．従来Sida crystallinaとされてきたが，日本産のものは本種である．
Spirulina princeps
【和名：】 側面から見るとジグザグ状，上部から見ると螺旋状の群体を形成する．幅は4.5～5μm，高層湿原に見られるが少ない．
Staurastrum dorsidentiferum var. ornatum
【和名： 】 かつては琵琶湖を代表するツヅミ藻の一種．現在では全国の池沼に普通に見られるほどに分布が拡大した．
